Aplicaciones para investigación en cáncer, genética humana, inmunología, células madre, biología del desarrollo, neurociencias y genética de poblaciones.

Provee herramientas para descubrimientos científicos que permiten revelar y comprender las complejidades de la biología en relación con la salud humana. A través de su novedosa tecnología que combina microfluidos, química y bioinformática en su sistema Chromium®, permite a los investigadores una comprensión acabada de los fundamentos biológicos a un nivel de resolución y escala sin precedentes

Empresa líder en el análisis de Células Únicas (Single Cell) mediante su tecnología de Gel Bead Emulsions

Para mayor información, haga click en el siguiente link: http://ow.ly/Z5p830ofm33

https://www.10xgenomics.com

Productos

Chromium Controller

Esta plataforma representa el corazón de la tecnología de 10x Genomics. Combina de manera rápida y eficiente la partición de un gran número de células, con una diversidad masiva de barcodes para generar > de 100.000 particiones marcadas con barcodes únicos en minutos. Es un sistema compacto de mesada que permite al usuario correr cualquier aplicación desde genoma completo hasta análisis de células únicas.

Single Cell Gene Expression

La tecnología de 10x Genomics proporciona una solución exhaustiva y escalable para la caracterización celular y medición de la expresión génica de cientos a miles de células únicas, con alto rendimiento. Esto posibilita el descubrimiento de la dinámica de expresión y el perfil molecular de múltiples tipos de células individuales. Los últimos desarrollos permiten detectar cada vez más transcriptos únicos por célula.

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Single Cell Immune Profiling

El análisis de perfil inmunológico de células únicas permite examinar con un enfoque exhaustivo el contexto celular de la respuesta inmune adaptativa y el repertorio inmune de  cientos a millones de linfocitos Ty B. Es una herramienta integral y escalable para el estudio de perfiles de transcripciones V(D)J pareadas de longitud completa.

El flujo de trabajo permite ir desde la preparación de la muestra, la secuenciación y el análisis con un software específico permitiendo descubrimientos en el área de la inmunología, la inmuno-oncología así como en enfermedades infecciosas.

Para mayor información ingrese en el siguiente link: http://ow.ly/Sr0930ofyx8

Single Cell CNV
El análisis de CNVs en células únicas proporciona una solución integral y escalable para revelar la heterogeneidad genómica celular y comprender la evolución clonal. Estudiar la patogenia de una enfermedad o caracterizar el mosaicismo neuronal a nivel de una sola célula.

Para mayor información ingrese en el siguiente link: http://ow.ly/DFXg30ofyHj
Single Cell ATAC
La aplicación ATAC (Assay for Transposase Accesible Chromatin) permite evaluar la accesibilidad de la cromatina en todo el genoma en cientos a miles de células al mismo tiempo para elucidar los mecanismos regulatorios  de le expresión génica y comprender la heterogeneidad epigenética en alta resolución.

Para mayor información ingrese al siguiente link: http://ow.ly/uaWP30ofAma
Genome Sequencing – Linked Reads

La tecnología de “Linked Reads” de 10x Genomics permite obtener información de lecturas más largas a partir de la tecnología de secuenciación de lecturas cortas de Illumina®. El análisis de genoma completo con esta tecnología permite facilitar el ensamblaje de las secuencias, resolver mutaciones intra o interalélicas (phasing), revelar variantes estructurales y acceder a regiones del genoma complejas y previamente inaccesibles.

Para mayor información ingrese al siguiente link: http://ow.ly/OhIE30ofAs5


Exome Sequencing – Linked Reads

La tecnología de “Linked Reads” de 10x Genomics permite obtener información de lecturas más largas a partir de la tecnología de secuenciación de lecturas cortas de Illumina®. Esto aplicado al análisis de exoma permite resolver variantes en fase (haplotipos),  variaciones estructurales y detección de número de copias.  Permite discriminar regiones de alta homología de secuencia incluyendo duplicaciones, inversiones y pseudogenes.

Para mayor información ingrese al siguiente link: http://ow.ly/eS0i30ofAGx
Softwares y Pipelines de Análisis

Cell Ranger DNA

Cell Ranger

Cell Ranger ATAC

Long Ranger

Supernova

Software de visualización de datos

Loupe scDNA Browser

Loupe cell Browser

Loupe V(D)J Browser

Loupe Genome Browser